Curso Taller: Introducción a la Bioinformática usando el sistema Linux

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Curso Taller: Introducción a la bioinformática usando el sistema Linux

El curso actualiza al participante en la aplicación de diferentes herramientas de software libre para el análisis de secuencias de DNA. Los estudiantes aprenderán a utilizar el entorno Linux y el lenguaje de programación bash, para el análisis de datos de secuenciación de DNA clásicos o que resultan del secuenciamiento de siguiente generación (NGS).
Además, el curso se enfocará en el desarrollo de ejercicios prácticos que permitan a los estudiantes familiarizarse con el sistema de comandos de Linux y utilizarlo en casos reales, como por ejemplo la minería de datos, la identificación de organismos y el manejo de scripts.

Dirigido a

Investigadores en ciencias de la vida, biomédicas, agrícolas, y veterinarias; estudiantes de pre/posgrado, interesados en áreas de genómica, biología molecular, bioinformática, epidemiología molecular, conservación de la biodiversidad, taxonomía, ecología.

Objetivos

Al final el proceso formativo, los estudiantes serán capaces de:

  • Utilizar comandos del lenguaje bash para analizar y organizar secuencias de genes o genomas obtenidas por métodos clásicos (Sanger) o de nueva generación (Illumina – NGS).
  • Utilizar programas en Linux, tanto de forma local como en servidores en la nube (cloud computing).
  • Diseñar y aplicar scripts para manejo de datos biológicos.

Certificación

  • Certificado

Cuando el participante haya aprobado satisfactoriamente las actividades según los requisitos establecidos y registrado una asistencia mínima de 70% a las actividades presenciales.

  • Constancia de participación o asistencia

Cuando el participante no haya superado la nota mínima aprobatoria o tenga inasistencia superior al 30% de las actividades presenciales.

Curso Taller: Introducción a la bioinformática usando el sistema Linux

Sesión 1

  • Sistema Linux
  • Máquinas virtuales
  • Comandos básicos
  • Formatos de archivos

Sesión 2

  • Manejando texto en Shell
  • Expresiones regulares. Loops.
  • Tareas iterativas
  • Minería de datos desde la terminal Linux

Sesión 3

  • Diseño y ejecución de scripts
  • Alineamientos locales y múltiples
  • BLAST desde la terminal Linux

Sesión 4

  • Servidores on line: CIPRES
  • Ejercicios prácticos
  • Presentaciones individuales y grupales de análisis basados en datos reales.

TOTAL DE CRÉDITOS: 02

Curso Taller: Introducción a la bioinformática usando el sistema Linux

Coordinador docente


Pedro E. Romero

Doctor en Ciencias Naturales por la Universidad Goethe (Frankfurt am Main, 2017) y Magíster en Biología Molecular por la UNMSM (2010). Docente de la Facultad de Ciencias y Filosofía (UPCH). Áreas de investigación: Evolución molecular, genética de poblaciones, filogenómica.



María Lisseth Eguiluz Moya

Doctora en Ciencias (Genética y Biología molecular) por la Universidad Federal de Rio Grande del Sur (Porto Alegre, 2018) y Magíster en Bioquímica y Biología Molecular por la UPCH (2014). Docente de la Facultad de Ciencias y Filosofía (UPCH). Áreas de investigación: Genómica, transcriptómica.

Curso Taller: Introducción a la bioinformática usando el sistema Linux

Pre requisitos
  • Conocimientos de biología molecular.
  • Laptop personal con sistema Windows 64 bits.
Requisitos
  1. Llenar ficha de registro
  2. Enviar recibo de pago al e-mail: epgvac.admision@oficinas-upch.pe
Información General
  • Vacantes*: 25
  • Créditos: 02
  • Fechas: Del 16 de marzo al 06 de abril
  • Horario: Sábados e de 09:00 a 16:00 hrs.
  • Sede: Campus Miraflores, Av. Armendáriz 445
(*) La UPCH se reserva el derecho de cancelar el programa si no llega al cupo mínimo de alumnos admitidos hasta el mismo día de inicio del programa.

Inversión

  • Profesionales en general: S/ 650.00
  • Alumnos y exalumnos UPCH (5%): S/ 617.00
  • Descuento corporativo y pronto pago (10%) : S/ 585.00
  • Pronto pago: S/ 585.00

Descuentos*

  • Descuento Corporativo (10%)
    Admisión de 3 participantes (como mínimo) de una misma institución al programa.
  • Descuento a ex alumnos (5%)
    Los ex alumnos de la UPCH tienen un beneficio del 5% de descuento en pensiones.
  • Pronto pago (10%)
    Los participantes que cancelen hasta el 28 de febrero, tendrán un descuento del 10% en el precio del curso.
(*) Los descuentos no son acumulables.

Modalidades de pago

  1. Tienda Virtual UPCH: www.tiendaupch.pe
  2. Caja UPCH: Pago en efectivo, tarjeta de Crédito Visa y MasterCard

Código tarifarios:

  • 892638 – Tarifa pago del curso
  • 892639 – Descuento alumnos y exalumnos (5%)
  • 892640 – Descuento corporativo o pronto pago (10%)
(*) En los Campus Miraflores y La Molina no se aceptan pagos en efectivo.

Campus Central

Dirección: Av. Honorio Delgado 430, Urb. Ingeniería. S.M.P.

E-mail: comunicaciones.epgvac@oficinas-upch.pe

Teléfonos: (51-1) 319 0000 anexos 210206-210207-210208

Campus Miraflores

Dirección: Av. Armendáriz 445, Miraflores

E-mail: informes.posgrado@oficinas-upch.pe

Teléfono: (51-1) 626-9400